新疆的小众旅游具有独特的魅力和吸引力，以下是一些值得一游的小众景点：

夏塔古道国家森林公园：

位于伊犁，夏塔草原在夏天能看到雪山，景色非常特别，是探险和摄影爱好者的天堂。

库木塔格沙漠：

位于吐鲁番附近，可以光脚进入沙丘，感受沙漠的壮观和震撼，傍晚时分坐在沙丘上看日落，氛围感极佳。

吐峪沟麻扎村：

古老的维吾尔族村落，可以欣赏到传统的民居、古巷和古树，还可以租用少数民族服装拍照。

高昌古城：

古丝绸之路的必经之地，古城规模宏大，可以感受到古代西域的历史和文化底蕴。

交河故城：

位于吐鲁番市郊，可以选择白天或夜游模式，领略古城的历史韵味。

千佛洞：

位于吐鲁番市郊，是一座佛教石窟遗址，适合对佛教文化感兴趣的游客。

赛里木湖：

位于伊犁，是一个高山湖泊，湖水清澈，环境优美，被称为“人间仙境”。

天鹅河景区：

位于库尔勒市，以洁白的天鹅和美丽的田园风光著称，是一个不为人知但非常美丽的景区。

安集海大峡谷：

位于安集海与奎屯之间，是大自然鬼斧神工造就的奇观，目前外界只有极少数人关注过。

达坂城盐湖：

位于达坂城，被称为“天空之镜”，是摄影爱好者的天堂。

潜龙渊步道：

通往天山天池的水晶宫殿，藏在山褶皱里的冰雪奇观，风景如画。

甘家湖梭梭林国家级自然保护区：

位于准噶尔盆地西南部，自然风光绝美，世界罕见。

和田龙湖湿地：

位于和田地区，因湖面蜿蜒曲折，形状似龙而得名，风光优美，环境清幽。

阿克苏沙棘林湿地：

位于阿克苏地区，溪流密布，沙棘丛生，风景秀丽。

阿克苏帕克勒克草原：

位于天山以南的沙漠边缘地带，夏季草场丰美，牛羊成群。

吐鲁番火云谷：

位于吐鲁番市高昌区，主要由赤红色砂、砾岩和泥岩组成，气势磅礴的“丹霞世界”。

鄯善库木塔格沙漠：

世界上为数不多与城市相连的沙漠，沙丘轮廓清晰，景色壮观。

东天山：

位于哈密，可以欣赏到绿洲、戈壁、草原、松林、雪峰等自然景观，还可以看到海市蜃楼。

天山庙：

位于天山之巅，是天山上唯一的一座庙宇，历史悠久，可以俯瞰辽阔的巴里坤大草原。

白石头：

因一块卧牛般大小的白色巨石而得名，有凄美的爱情传说。

这些小众景点不仅人少景美，而且各具特色，是体验新疆独特风光和文化的绝佳选择。建议根据自己的兴趣和时间安排，选择几个景点进行深度游。