根据《水浒传》的描述，孙二娘曾害过的梁山好汉主要有以下两位：

鲁智深

鲁智深因酒醉误入孙二娘的十字坡黑店，险些被其用蒙汗药下毒。幸得张青及时求情，双方化解误会，最终成为兄弟。这一情节展现了孙二娘的凶残与鲁智深的机智。

宋江

宋江在征方腊前曾被李立用蒙汗药下毒，幸亏李俊及时相救。李立与孙二娘同为黑店经营者，手段更为狠毒，甚至对梁山好汉下毒。

补充说明：

孙二娘在梁山排名第一百零三，以“母夜叉”著称，其黑店以蒙汗药和人肉包子闻名，导致多人丧命。- 除上述两人外，其他梁山好汉如戴宗、周通等也曾被其蒙汗药所害，但权威性较低或情节较简略。