《爱情公寓5》中关谷神奇和唐悠悠缺席的原因如下：

王传君主动退出

关谷神奇的扮演者王传君因与剧组合作问题明确表示不再参演。他在《爱情公寓》大电影中已提前退出，并在采访中提到“合作不下去了”，认为双方难以调和矛盾。

剧情连贯性调整

关谷与唐悠悠是剧中核心情侣，两人戏份较多。王传君的退出导致唐悠悠角色戏份减少，编剧为避免剧情单薄，选择调整剧情线，例如将“宝贝计划”等关键情节转移给其他角色。

演员个人发展需求

两位演员均希望拓展事业，王传君通过退出减少与《爱情公寓》的绑定，邓家佳也逐步转向其他影视项目，双方均认为这是对粉丝的交代。

观众情感共鸣考量

关谷与唐悠悠的结局（未明确结婚）是观众期待的高光。剧组在最终季通过补办婚礼等方式，尽量满足粉丝对这对CP的情怀，但未恢复两人正式出场。

综上，关谷与唐悠悠的缺席是演员主动选择与剧情调整共同作用的结果，剧组在尊重演员意愿的同时，也兼顾了剧集连贯性。