员工旅游发票的入账方式主要取决于旅游费用是由公司支付还是由员工个人支付。以下是具体的入账方法：

公司集体出游

作为集体福利，公司需做如下分录处理：

借：管理费用—福利费

贷：应付职工薪酬—非货币性福利

员工个人旅游

公司可以报销的部分，一般计入到该员工工资，计算缴纳个人所得税

企业支付的费用

应计入管理费用—福利费科目进行核算，且福利费的支出总和不超过职工工资总额的14%

员工自行支付的部分

企业不应该入账，也不得在税前扣除

特殊情况的处理

如果企业为营销业绩突出人员组织的旅游活动，通过免收差旅费、旅游费对个人实行的营销业绩奖励，应根据所发生费用全额计入营销人员应税所得，依法征收个人所得税，并由提供上述费用的企业代扣代缴

综上所述，员工旅游发票的入账方式主要依据费用支付主体和用途来确定。公司支付的集体旅游费用计入福利费，员工个人支付的费用则计入工资并需缴纳个人所得税。企业在处理时需遵守相关税法规定，确保账务处理的合规性。