重庆三中本部（重庆南开中学）目前没有设置初中部。根据现有信息分析如下：

重庆三中本部定位

重庆三中本部是重庆市沙坪坝区公办高中，位于沙坪坝区沙南街1号，主要承担高中教育任务。

初中部设置情况

- 其初中部为 重庆融侨南开中学（原一三八初中部），属于 民办初中，位于南岸区风临路10号。

- 另有 重庆南开中学大学城校区（民办初高中），位于两江新区龙兴工业园。

关于其他说法的澄清

- 部分低权威性信息提到“本部有两个教学班”或“针对艺体特长生和教师子女班”，这些内容可能与特殊班级或小型教学点有关，但并非独立初中部。

总结：

若需就读重庆三中体系内的初中，应选择融侨南开中学或大学城校区，而非本部。