马政寺的由来与历史传说及官方重建密切相关，主要可归纳为以下几点：

纪念性起源

马政寺相传始建于明初，最初为纪念朱元璋之妻马政娘娘而建。马政娘娘在民间传说中以放粮赈灾的善举闻名，明太祖朱元璋为其立庙奉祀，故称“马政庙”。

建筑与功能演变

- 初期作为道教宫观（娘娘殿），后因纪念马政娘娘而转为佛教寺院。

- 清朝时期，由龚大司马重建并扩建，形成三进式建筑格局，以色墙、浮雕为特色，被誉为“安徽小故宫”。

历史变迁与保护

- 元末战乱期间，原主持僧韩小斋建议刘铭传重建寺庙，后经龚仰（四川方伯公）再次修葺。

- 现存碑文记载了多次重建细节，体现了不同时期的宗教与文化融合。

文化意义

- 除宗教功能外，马政寺还承载着地方民俗活动，如每年农历三月初三举办的庙会，成为合肥重要的文化旅游活动。

综上，马政寺是历史与信仰交织的产物，既承载着对历史人物的纪念，也体现了宗教建筑与地方文化的互动。